نوع جداگانه
ماژول غشایی و بیوراکتور به طور جداگانه نصب می شوند.
مایع مخلوط در بیوراکتور توسط یک پمپ گردشی تحت فشار قرار می گیرد و سپس به انتهای فیلتراسیون ماژول غشایی پمپ می شود. تحت فشار، مایع موجود در مشروب مخلوط از طریق غشاء نفوذ می کند و به آب تصفیه شده تبدیل می شود. جامدات و مولکول های بزرگ توسط غشاء حفظ می شوند و با کنسانتره به بیوراکتور بازگردانده می شوند.
نوع یکپارچه
ماژول غشایی در داخل بیوراکتور قرار می گیرد. آب خوراک وارد بیوراکتور غشایی می‌شود، جایی که بیشتر آلاینده‌ها توسط لجن فعال در مایع مخلوط حذف می‌شوند و سپس آب توسط غشاء تحت فشار خارجی فیلتر می‌شود.
این نوع{0}}بیوراکتور غشایی مصرف انرژی نسبتاً کمی دارد زیرا سیستم گردش مایع مخلوط را حذف می‌کند و به فیلتراسیون به کمک پمپ متکی است. همچنین دارای ردپای فشرده تری نسبت به نوع جداگانه است و در سال های اخیر در زمینه تصفیه آب مورد توجه قابل توجهی قرار گرفته است. با این حال، به طور کلی شار غشایی نسبتاً کمی دارد، مستعد رسوب غشایی است و تمیز کردن و تعویض آن پس از رسوب گیری دشوار است.
نوع مرکب
از نظر شکل نیز به دسته بیوراکتورهای غشایی یکپارچه تعلق دارد. تفاوت این است که مواد بسته بندی در داخل بیوراکتور برای تشکیل یک بیوراکتور غشایی مرکب اضافه می شود که برخی از خواص راکتور را تغییر می دهد.
